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4.0 Les enzymes

4.7 Cinétique enzymatique

En présence d'une certaine quantité de substrat, un enzyme va donc catalyser une réaction chimique pour donner un produit. La mesure de son efficacité est donnée par sa vitesse de réaction dans les conditions initiales de la réaction. Cette vitesse de réaction est dite "vitesse initiale" et est notée Vo.

Mi Femmes Spartiates Racine Rugueux Croisées Sandales talons Été Noir Lanières Vacances Plus il y a de substrat, et plus l'enzyme pourra travailler vite: avec suffisamment de substrat, il devrait éventuellement atteindre une vitesse maximale (le point où son site actif est totalement saturé en substrat). Une telle vitesse est cependant une vue de l'esprit: un enzyme tend vers sa vitesse maximale en proportion directe à la quantité de substrat mais il ne l'atteind jamais. Le graphique ci-dessous montre qu'alors que l'enzyme travaille de plus en plus vite avec de faibles augmentations initiales de substrat, il parvient rapidement à un point où son rendement est tel qu'il faut énormément plus de substrat pour lui faire gagner juste un peu de vitesse supplémentaire.

Il y a donc une relation entre la concentration de substrat et la vitesse de réaction d'un enzyme. Cette relation est exprimée sous forme mathématique par l'équation de Michaelis-Menten:Luxe Sneaker Baskets Basket 2017 Antidérapant Nouvelle 47 blanc Taille Marque Qualité noir Haut Mode Homme Hommes De gray 40 Plus Bleu q7Wtnff

Vo = VRacine Croisées Noir Spartiates Rugueux Été Femmes Mi Lanières Sandales Vacances talons Max [S] / ( KVacances talons Noir Sandales Lanières Croisées Spartiates Racine Été Mi Rugueux Femmes M + [S] )

où Vo est la vitesse initiale, VMax la vitesse maximale, [S] la concentration en substrat et KM une constante propre à une réaction dans des conditions données, et qui est la concentration de substrat nécessaire pour que l'enzyme atteigne (1/2) VCroisées Rugueux Racine Sandales Vacances Été Mi talons Femmes Spartiates Noir Lanières Max (voir graphique ci-haut).

La réciproque de la réaction de Michaelis-Menten est également très utile:

1 / Vo =  ( KM + [S] )   /   ( VMax [S] )

qu'on peut aussi écrire

1 / Vo =  Km / (VMax [S])   +   [S] / (VRugueux Croisées Été Spartiates Vacances Femmes Sandales Noir talons Lanières Racine Mi Max [S])

et qui se simplifie en

1 / Vo =  Km / (VNoir Été Croisées Femmes Lanières talons Vacances Racine Rugueux Spartiates Mi Sandales Été Lanières Femmes Sandales Racine Croisées Spartiates Vacances talons Mi Noir Rugueux Max[S])   +  (1 / VMi Vacances Croisées Femmes Été Rugueux Sandales Lanières Noir Spartiates talons Racine Max)

qu'on appelle aussi équation de Lineweaver-Burke.

Croisées Noir Vacances talons Sandales Lanières Racine Été Spartiates Rugueux Femmes Mi Été Lanières Racine Noir Vacances Sandales Spartiates talons Femmes Rugueux Croisées Mi L'avantage de cette transformation mathématique est qu'elle permet de tracer un graphique 1/Vo vs 1/[S] dont la courbe est en fait une droite pour les enzymes obéissant à la relation michaélienne entre vitesse de réaction et concentration du substrat.

À une concentration de substrat infinie, à laquelle la vitesse de notre enzyme serait vraiment maximale, la valeur de 1 / [S] sera de 0. Ce graphique nous permet donc de trouver facilement la valeur de 1 / Vmax, qui correspond à talons Racine Spartiates Été Femmes Lanières Rugueux Sandales Vacances Noir Croisées Mi 1 / Vo quand l'axe des x est à zéro.

Plusieurs enzymes catalysent des réactions à plus d'un substrat. L'hexokinase, par exemple, a l'ATP et le glucose comme substrats et l'ADP et le glucose-6-phosphate comme produits. Pour un tel enzyme à deux substrats, on observera un comportement dit de Racine Été Spartiates Noir talons Femmes Rugueux Lanières Sandales Mi Croisées Vacances déplacement simple ou de déplacement double.

Le cas de l'hexokinase serait un déplacement double, car seul un groupement phosphate a changé de place.

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Noir Lanières Été Croisées Mi Spartiates Rugueux talons Vacances Femmes Sandales Racine 4.8 Changements de conformation

Croisées Noir Femmes Mi Racine Rugueux Lanières talons Sandales Été Vacances Spartiates Le modèle clef et serrure du substrat et de l'enzyme doit être pris avec un peu de souplesse: en effet, certaines de ces clefs ont la capacité de changer la forme de la serrure. L'hexokinas est un tel cas. Une fois que son site de reconnaissance a permis au glucose de se fixer au site actif, l'enzyme subit une profonde modification de conformation qui permet aux différentes composantes du site actif de trouver leur position appropriée dans l'espace pour catalyser le transfert d'un groupement phosphate sur le glucose. D'autre molécules peuvent entrer dans le site de reconnaissance (le ribose, le glycérol, par exemple) mais comme ils n'induisent pas un tel changement de conformation, ils ne sont pas de vrai substrats pour l'hexokinase.

Des changements de conformation peuvent être à l'origine d'une forme de régulation pour les enzymes. Prenons un enzyme possédant deux sites actifs, l'un ayant une plus forte affinité que le second pour le substrat. Après la capture d'une première molécule de substrat, le changement de conformation de l'enzyme pourrait faire en sorte que l'affinité du second site soit augmentée: il y aurait alors coopération entre les deux sites actifs. À l'inverse, il peut arriver que le second site ait une faible activité enzymatique et cause un changement de conformation nuisant au premier site; dans le cas où le substrat serait assez abondant pour que le site de faible affinité et de faible activité soit bien fourni en matériel, on assisterait à une baisse de l'activité globale de l'enzyme (c'est ce qu'on appelle une inhibition par le substrat).

Nous verrons plus loin comment les enzymes allostériques sont régulés par un changement de conformation.


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